Les changements de distribution et la sélection naturelle résultant des changements climatiques passés sont des facteurs importants dans la détermination de la structure génétique des espèces forestières. Kimura et al. utiliser une combinaison de méthodes de modélisation de la phylogéographie et de la distribution des espèces pour identifier les réponses des cryptomeria japonica, endémique de l'archipel japonais, aux changements climatiques passés. Ils identifient quatre pools de gènes, dont l'un a probablement été établi par des refuges cryptiques. Un cline de diversité génétique ambigu le long des altitudes serait prédit par le modèle de distribution et l'accessibilité des populations refuges après le dernier maximum glaciaire, suggérant que de multiples événements de refuge et / ou de mélange ont affecté la structure globale de la diversité génétique.