El raps o canola (Brassica napus) es uno de los cultivos oleaginosos más importantes del mundo. La deficiencia de fosforo (P) diminue plusieurs fois l'altitude de la plante et le nombre de rameaux. Sin embargo, las bases genéticas que controlan la altura y el número de ramas en B.napus en condition de carence de fosforo siguen siendo desconocidas. Liu y colaboradores se propusieron buscar genes candidatsos para la altura y el número de ramas mediante un estudio de asociación del genoma (por sus siglas en inglés GWAS, étude d'association à l'échelle du génome) et déterminer les haplotipos tolérants à des conditions réduites de fosforo.

Canola. Image : canva.

Un panel d'association de B.napus fue cultivée en camp avec un suministro bajo de fosforo (P, 0 kg ha-1) et avec un suministro suffisant (P, 40 kg ha-1). Durante 2 ans se registró la altura de las plantas y el número de ramas. Se utilizaron más de 5 millions de polimorfismos de un solo nucleótido (SPNs) para realizar GWAS de l'altura y número de ramas a dos condiciones contrastantes de fósforo suministrado.

Un total de 2127 SNP appartenant à la grande association (P < 6·25 × 10-07) avec l'altitude et le nombre de hauteurs dans les conditions du fosforo. Il existe une corrélation significative entre la variation fenotípica et le nombre d'alelos favorables des loci associés aux chromosomes A10 (chrA10 821671) et C08 (chrC08 27999846), ce qui contribue à l'amélioration de l'agrégation de ces SNP. Les gènes candidats BnaA10g0929OD y BnaC08g26640D están asociados a los loci chrA10 821671 et chrC08 27999846 respectivement. Los análisis de genes candidatos y de haplotipos mostraron que las líneas endogámicas portadoras de ATT en BnaA10g0929OHap1 y AAT fr BnaC08g26640Hap1 Il y a une grande hauteur dans des conditions avec un faible niveau de force pour les lignes porteuses d'autres autres.

Ces lieux de SNP significatifs, les alelos et les haplotipos favorables et les accessions qui portent ces alelos et haplotipos seront utiles pour l'amélioration et l'obtention de cultivars de B.napus tolérant des conditions basses de fosforo.

ARTICLE DE RECHERCHE

Liu, H., Wang, J., Zhang, B., Yang, X., Hammond, JP, Ding, G., Wang, S., Cai, H., Wang, C., Xu, F., Shi , L., 2021. Une étude d'association à l'échelle du génome dissèque le contrôle génétique de la hauteur des plantes et du nombre de branches en réponse à un stress à faible teneur en phosphore chez Brassica napus. Annals of Botany. https://doi.org/10.1093/aob/mcab115

traduction espagnole par Lorena Marchant