Auparavant, j'ai décrit la compilation d'une liste de 517 citations classiques contemporaines en sciences végétales (1992-2017) et révélé les auteurs, les revues et les organisations représentées dans ces articles. Ici, j'étudie les sujets de ces articles et j'essaie de prédire quelques Citation Classics du futur.

Mots apparaissant dans les titres de Citation Classics in Plant Sciences depuis 1992.
Mots apparaissant dans les titres de Citation Classics in Plant Sciences depuis 1992. La taille de la police indique la fréquence relative d'apparition.

Le mot le plus courant dans les titres de Citation Classics in Plant Sciences depuis 1992 était « plante », qui figurait dans 38 % de tous les titres. D'autres mots courants étaient « stress », « réponse », « gène », « expression » et, bien sûr, « arabidopsis ». Ce dernier est apparu dans 11% de tous les titres. Ce n'est sans doute pas surprenant puisque cette petite plante diploïde et autofertile a fait l'objet d'un nombre toujours croissant de publications en Sciences du végétal entre 1992 (1.9 % des publications) et 2017 (18.9 % des publications). Aujourd'hui, il semble y avoir presque autant de publications en sciences végétales sur arabidopsis que sur toutes les grandes cultures du monde réunies. Mais permettez-moi d'émettre une mise en garde pour ceux d'entre vous qui se précipitent maintenant pour écrire un article intitulé "La réponse de l'expression des gènes chez les plantes arabidopsis au stress"; ce qui était autrefois un sujet populaire ne doit pas nécessairement continuer à l'être. J'ai essayé de repérer « nourriture », « sécurité », « climat » et « changement » dans le nuage de mots, mais je n'y suis pas parvenu. Peux-tu?

Pourcentage d'articles de la catégorie « Sciences végétales » du Web of Science dont le sujet était « arabidopsis » ou l'une des principales cultures (canne à sucre, maïs, blé, riz, pomme de terre, soja, palmier à huile, betterave, manioc, tomate, orge, brassicacées ou alliacées).
Pourcentage d'articles dans la catégorie Web of Science "Plant Sciences" dont le sujet était "arabidopsis" ou l'une des principales cultures (canne à sucre, maïs, blé, riz, pomme de terre, soja, palmier à huile, betterave, manioc, tomate, orge, brassicas ou alliums).

Tenté d'écrire une critique? La plupart des Citation Classics contemporains que j'ai identifiés étaient soit des articles de recherche (39.6%) soit des revues (59.6%). Lorsque la proportion relative de chacun est tracée par rapport à l'année de publication, la proportion d'articles de recherche dans la cohorte annuelle est plus petite au début et à la fin de la série chronologique. Cela suggère qu'un article de recherche prend plus de temps qu'une critique pour devenir un Citation Classic et que sa notoriété est plus courte. Incidemment, comme on pouvait s'y attendre, puisque seulement 4% de toutes les publications sont des critiques mais que plus de 53% des Citation Classics sont des critiques, on peut conclure qu'une critique a plus de chances de devenir un Citation Classic qu'un autre type d'article. Environ 1 avis sur 40 deviendra Citation Classics, contre 1 article de recherche sur 800. Donc, si vous voulez un Citation Classic en un temps record, avec les meilleures chances de succès, vous devriez écrire une critique populaire.

Proportion de Citation Classics contemporains qui étaient des articles de recherche ou des critiques chaque année entre 1992 et 2012.
Proportion de Citation Classics contemporains qui étaient des articles de recherche ou des critiques chaque année entre 1992 et 2012.

Enfin, une prédiction : j'ai précédemment noté que le nombre moyen de Citation Classics était d'environ 0.2 % du nombre total d'articles publiés chaque année, soit un cinquième du 1 % d'articles désignés "Highly Cited" sur Web of Science. . Afin de prédire les Citation Classics du futur, on pourrait examiner une cohorte annuelle « Highly Cited » et sélectionner les articles les plus cités. Ainsi, par exemple, si je devais prédire 20 articles (11 critiques et 9 articles) de 2011 qui pourraient devenir Citation Classics d'ici 2025, ceux-ci seraient, par ordre d'ascendance probable :

  1. Mittler R, et al. (2011) Signalisation ROS : la nouvelle vague ? Tendances en sciences végétales 16, 300-309. [718 citations] https://www.cell.com/trends/plant-science/fulltext/S1360-1385(11)00055-0
  2. Foyer CH, Noctor G (2011) Ascorbate et glutathion : Le cœur du hub redox. Physiologie végétale 155, 2-18. [649 citations] http://www.plantphysiol.org/content/155/1/2
  3. Robert-Seilaniantz A, et al. (2011) Diaphonie hormonale dans les maladies et la défense des plantes : plus qu'un simple antagonisme jasmonate-salicylate. Revue annuelle de phytopathologie 49, 317-343. [630 citations] https://www.annualreviews.org/doi/10.1146/annurev-phyto-073009-114447

qui étaient sur ma liste d'origine

  1. Cardinale BJ, et al. (2011) Le rôle fonctionnel de la diversité des producteurs dans les écosystèmes. Journal américain de botanique 98, 572-592. [448 citations] https://onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.3732/ajb.1000364
  2. Rascio N, Navari-Izzo F (2011) Plantes hyperaccumulatrices de métaux lourds : comment et pourquoi le font-elles ? Et qu'est-ce qui les rend si intéressants ? Sciences végétales 180, 169-181. [415 citations] https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0168945210002402
  1. Rumpel C, Kogel-Knabner I (2011) Matière organique du sol profond - un élément clé mais mal compris du cycle du C terrestre. Plante et sol 338, 143-158. [415 citations] https://link.springer.com/article/10.1007/s11104-010-0391-5
  2. Furbank RT, Tester M (2011) Phenomics - technologies pour soulager le goulot d'étranglement du phénotypage. Tendances en sciences végétales 16, 635-644. [390 citations]
    https://www.cell.com/trends/plant-science/fulltext/S1360-1385(11)00209-3
  3. Foyer CH, Shigeoka S (2011) Comprendre le stress oxydatif et les fonctions antioxydantes pour améliorer la photosynthèse. Physiologie végétale 155, 93-100. [370 citations] http://www.plantphysiol.org/content/155/1/93
  4. Blackwell M (2011) Les champignons : 1, 2, 3… 5.1 millions d'espèces ? Journal américain de botanique 98, 426-438. [359 citations] https://onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.3732/ajb.1000298
  5. Leivar P, Quail PH (2011) PIF : composants essentiels dans un hub de signalisation cellulaire. Tendances en phytologie 16, 19-28. [344 citations] https://www.cell.com/trends/plant-science/fulltext/S1360-1385(10)00162-7
  1. Smith SE, Smith FA (2011) Rôles des mycorhizes arbusculaires dans la nutrition et la croissance des plantes : nouveaux paradigmes de l'échelle cellulaire à l'échelle de l'écosystème. Revue annuelle de biologie végétale 62, 227-250. [335 citations] https://www.annualreviews.org/doi/10.1146/annurev-arplant-042110-103846
  2. Soltis DE, et al. (2011) Phylogénie des angiospermes : 17 gènes, 640 taxons. Journal américain de botanique 98, 704-730. [334 citations] https://onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.3732/ajb.1000404
  3. Fernandez-Calvo P, et al. (2011) Les facteurs de transcription arabidopsis bHLH MYC3 et MYC4 sont des cibles des répresseurs JAZ et agissent de manière additive avec MYC2 dans l'activation des réponses au jasmonate. Plant Cell 23, 701-715. [329 citations] http://www.plantcell.org/content/23/2/701
  4. Thomma BPHJ, et al. (2011) Des PAMP et des effecteurs : la dichotomie floue PTI-ETI. Cellule végétale 23, 4-15. [328 citations] http://www.plantcell.org/content/23/1/4
  5. Cuperus JT, et al. (2011) Évolution et diversification fonctionnelle des gènes MIRNA. Cellule végétale 23, 431-442. [327 citations] http://www.plantcell.org/content/23/2/431
  1. Fujita Y et al. (2011) Régulation transcriptionnelle médiée par l'ABA en réponse au stress osmotique chez les plantes. Journal of Plant Research 124, 509-525. [323 citations] https://link.springer.com/article/10.1007/s10265-011-0412-3
  2. Peleg Z, Blumwald E (2011) Équilibre hormonal et tolérance au stress abiotique chez les plantes cultivées. Opinion actuelle en biologie végétale 14, 290-295. [319 citations] https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1369526611000069
  3. Chen F, et al. (2011) La famille des terpènes synthases chez les plantes : une famille de gènes de taille moyenne pour le métabolisme spécialisé et très diversifiée à travers le royaume. Journal de l'usine 66, 212-229. [316 citations] https://onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1111/j.1365-313X.2011.04520.x
  4. Endelman JB (2011) Régression Ridge et autres noyaux pour la sélection génomique avec R Package rrBLUP. Génome végétal 4, 250-255. [315 citations] https://dl.sciencesocieties.org/publications/tpg/abstracts/4/3/250
  5. Lux A, et al. (2011) Réponses racinaires au cadmium dans la rhizosphère : une revue. Tourillon de botanique expérimentale 62, 21-37. [313 citations] https://academic.oup.com/jxb/article/62/1/21/514644

Comme vous pouvez le constater, il existe de nombreux auteurs, revues et sujets de recherche populaires sur cette liste qui ont figuré dans les trois articles de blog que j'ai écrits pour Botany One. Le passé prédira-t-il l'avenir ? Nous devrons attendre et voir.