Les basses températures au début de la saison de croissance peuvent nuire à la productivité des espèces cultivées. Le refroidissement (0 – 20°C) et la congélation (< 0°C) affectent négativement la croissance et le développement des plantes. Le coton est une culture importante et la principale source de fibres naturelles pour les industries textiles. La production de coton a été durement touchée par divers stress abiotiques, y compris le stress dû au froid, provoqués par une faible diversité génétique et une sélection intensive. L'utilisation du matériel génétique du coton sauvage dans les efforts de sélection a le potentiel de résoudre le problème du stress abiotique et d'augmenter la diversité génétique du coton cultivé. Cependant, en raison de la quantité limitée d'informations génomiques disponibles pour les espèces de coton sauvage, peu d'études ont été en mesure de fournir une interprétation complète des changements transcriptomiques du coton en réponse à l'acclimatation au stress froid.

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L'espèce de coton sauvage Gossypium thurberi est adaptée à une large gamme de températures. Crédit image : K. Schultz (via Flickr)

Dans une étude récente publiée dans AoBP, Cai et al. changements de transcription comparés dans les feuilles de Gossypium thurberi sous stress froid en utilisant le séquençage du transcriptome à haut débit. G. thurberi est une espèce de coton sauvage qui s'est adapté à une large gamme de températures et est plus tolérant au stress du froid. L'analyse du transcriptome et la technique ARNi ont révélé le rôle intégral joué par deux nouveaux gènes, CBF4 et ICE2 dans l'amélioration de la tolérance au stress froid chez cette espèce de coton sauvage. Ces découvertes révèlent un nouveau réseau de régulation de la réponse au stress dû au froid chez les G. thurberi et élargir notre compréhension du mécanisme de tolérance au froid du coton. Les auteurs déclarent que ce travail contribuera à accélérer les futures études de génomique fonctionnelle et l'amélioration génétique de la tolérance au stress froid chez le coton cultivé.