On sait peu de choses sur les raisons pour lesquelles certaines souches de rhizobium ne parviennent pas à former des associations symbiotiques réussies avec des plantes légumineuses. melino et al. comparer incompatible (pas de N2-fixation) et peu compatible (N réduit2-fixation) associations entre quatre génotypes de trèfle (trifolium spp.) et quatre souches de Rhizobium leguminosarum par exemple. trifolié et évaluer l'efficacité symbiotique par une variété de mesures. Ils trouvent trois réponses majeures à l'incompatibilité, à savoir l'échec de l'endocytose bactérienne des fils d'infection dans les cellules corticales végétales, la différenciation des bactéroïdes qui avorte prématurément et un pool réduit de bactéroïdes fonctionnels en raison d'une sénescence prématurée. Ainsi, les mauvaises réponses de croissance des plantes résultant de la nodulation par des souches incompatibles peuvent désormais être liées à des aberrations morphologiques spécifiques.
