Vandenboschia speciosa est une espèce de fougère très vulnérable, avec un gros génome (10.5 Gb). Les gamétophytes haploïdes et les sporophytes diploïdes sont pérennes, peuvent se reproduire végétativement et certaines populations ne sont composées que de gamétophytes indépendants. Ces caractéristiques font de cette fougère un bon modèle :
- pour l'analyse à haut débit de l'ADN satellite (ADN sat) afin d'étudier les tendances évolutives possibles des caractéristiques de la séquence d'ADN sat ;
- déterminer la contribution relative de l'ADN sat et d'autres ADN répétitifs à son grand génome ; et
- pour analyser si le mode de reproduction ou l'alternance de phase entre les stades haploïdes et diploïdes de longue durée influence l'abondance ou la divergence de l'ADN sat.
Ruiz-Ruano et al. ont analysé la fraction répétitive du génome de cette espèce dans trois populations différentes (dont une composée uniquement de gamétophytes indépendants) en utilisant le séquençage Illumina et l'analyse bioinformatique avec RepeatExplorer et satMiner.
Ils ont découvert que les satellites plus longs (et plus anciens) V.speciosa ont un contenu A + T plus élevé et évoluent à partir de plus courts et, dans certains cas, les microsatellites ont été une source de nouveaux ADN sat. Fait intéressant, le satellitome n'explique pas l'énorme taille du génome de cette espèce alors que les TE sont le principal composant répétitif du V.speciosa génome et contribuent principalement à son grand génome. Ils ont également constaté que le mode de reproduction ou l'alternance de phase entre les gamétophytes et les sporophytes n'entraîne pas d'accumulation ou de divergence de satellites.
