Bananes (Musa spp.) sont un aliment de base majeur pour des centaines de millions de personnes dans les pays en développement. Les variétés cultivées sont des clones apépins et parthénocarpiques dont l'origine ancestrale reste à préciser. Les cultivars les plus importants sont les triploïdes de constitution génomique AAA, AAB ou ABB, les génomes A et B étant fournis par M. acuminé et M. balbisiana, respectivement. Des études antérieures ont suggéré que les recombinaisons inter-génomes étaient relativement courantes chez les cultivars de bananier et que les triploïdes étaient plus susceptibles d'avoir traversé un hybride intermédiaire. Dans cette étude, Alberto Cenci et ses collègues ont étudié la structure chromosomique au sein du groupe ABB, composé de bananes à cuire féculentes qui jouent un rôle important dans la sécurité alimentaire.

Les échanges homologues récurrents (HE), c'est-à-dire les échanges de chromatine entre les sous-génomes A et B, ont été démêlés avec au moins neuf événements fondateurs (modèles HE) à l'origine des bananes ABB avant la diversification clonale. Deux événements fondateurs indépendants ont été trouvés pour les génotypes Pisang Awak. Deux profils HE, correspondant aux génotypes Pelipita et Klue Teparod, montrent une surreprésentation de la contribution du génome B. Trois modèles HE trouvés principalement dans les accessions indiennes partageaient certaines régions recombinées et deux modèles supplémentaires ne correspondaient à aucun sous-groupe connu.

La découverte des neuf événements fondateurs a permis une enquête sur les voies possibles qui ont conduit à la création des différents sous-groupes, ce qui a abouti à de nouvelles hypothèses. Sur la base de nos observations, nous proposons différentes voies qui ont donné lieu à la diversité actuelle des cultivars ABB, des voies impliquant des hybrides AB primaires, des voies conduisant à des HE partagées et des voies conduisant à un ratio d'excès de B. Des flux génétiques ont eu lieu entre M. acuminé et M. balbisiana, notamment en Inde, d'où sont originaires ces hybrides AB déséquilibrés et allotriploïdes ABB, et où sont cultivés M. balbisiana sont abondants. Le résultat de cette étude clarifie la classification des cultivars ABB, conduisant éventuellement à la révision de la classification de ce sous-groupe.

"Par rapport aux méthodes d'analyse précédentes pour évaluer la diversité génétique du pool génétique du bananier, l'étude du génome entier basée sur le séquençage de nouvelle génération (NGS ; RADSeq dans cette étude) fournit une image détaillée et exhaustive de la composition du génome", écrivent Cenci et collègues. "Par conséquent, nous recommandons de compléter la caractérisation basée sur la SSR avec des technologies NGS telles que RADSeq en tant que méthode standard pour caractériser les accessions de banques de gènes de bananier et les classer de manière objective, opportune et reproductible."