
La science a toujours été un « grand » sujet – et pas seulement ces projets de physique terrabucks – elle pose certaines des plus grandes questions de toutes : qui sommes-nous ? pourquoi sommes nous ici? Pourquoi lis-tu ça? Mais, comme la technologie a amélioré notre capacité à aborder ces grandes questions, elle a également augmenté notre capacité à générer des quantités encore plus importantes de données. Le problème, c'est où pouvez-vous publier toutes ces "trucs", les grands ensembles de données eux-mêmes et les soi-disant métadonnées – 'des données sur des données' ? Eh bien, tout comme autrefois, si vous vouliez publier des sujets obscurs, vous lanciez votre propre journal, l'équivalent du 21e siècle - qui exploite à juste titre une partie de cette nouvelle technologie - est GigaScience, Giga-base de données et GigaBlog: 'de nouvelles ressources pour la communauté du big data'. GigaScience, 'un nouveau type de journal' de BioMed Central et BGI, accepte désormais les candidatures dans le but de traiter de nombreuses questions liées au « big data ». GigaScience vise à "révolutionner la diffusion, l'organisation, la compréhension et l'utilisation des données". Revue en ligne de données ouvertes en libre accès, nous publions des études « big data » sur l'ensemble du spectre des sciences de la vie et biomédicales. Pour atteindre nos objectifs, la revue a un nouveau format de publication : un format qui relie la publication de manuscrits standard à une base de données complète qui héberge toutes les données associées et fournit des outils d'analyse de données et des ressources de cloud computing. Au cas où vous vous demanderiez ce qui est qualifié de "grand" ou "à grande échelle" dans ce contexte, la réponse officielle est... "ça dépend" (!). Cependant, cette décision semble être opportune car nous lisons qu'un effort multi-institutionnel soutenu par le Département américain de l'énergie (DOE) prend de nombreux flux distincts d'informations biologiques pour créer un seul cyber-'knowledgebase' (Kbase en abrégé). L'un des principaux objectifs de Kbase est de "se concentrer sur un assortiment spécifique de plantes et de microbes que le département de l'énergie espère exploiter pour produire des biocarburants, séquestrer le carbone dans l'écosystème et nettoyer la pollution de l'environnement". Pour contribuer à l'expansion de la recherche sur les écosystèmes, la première partie d'un base de données, qui comprend « 3 millions de traits pour 69,000 300,000 des quelque 130 XNUMX espèces végétales du monde », a été publié par Jens Kattge et > XNUMX collègues (Global Change Biology; doi : 10.1111/j.1365-2486.2011.02451.x). Parmi les ambitions de TRY (comme on le sait, qui n'est pas un acronyme, mais "plutôt l'expression d'un sentiment") est que l'amélioration de la disponibilité des données sur les traits des plantes dans sa base de données mondiale unifiée "soutiendra un changement de paradigme d'une écologie basée sur les espèces, offrira de nouvelles opportunités pour la recherche sur les traits synthétiques des plantes et permettre une représentation plus réaliste et empiriquement fondée de la végétation terrestre dans les modèles du système terrestre ». Espérons que l'équipe continue… euh… d'essayer ! Enfin, et à une échelle plus modeste mais contribuant également à de grands ensembles de données, le Centre for Ecology & Hydrology du Royaume-Uni a publié son troisième carte d'occupation du sol pour le Royaume-Uni. Produite à une résolution de 25 m, la couverture terrestre a été dérivée de « plus de 70 images satellites » et contient des informations spectrales qui correspondent à différentes surfaces au sol et types de végétation en été comme en hiver. Un processus de classification automatisé a été utilisé pour attribuer un type de couverture terrestre, sur la base d'un Plan d'action pour la biodiversité (BAP) Les habitats généraux, couvrant environ 10 millions de parcelles, sont largement utilisés pour le suivi et l'établissement de rapports sur les campagnes britanniques. La nouvelle carte révèle que la couverture terrestre du Royaume-Uni est principalement composée de « terres arables et horticoles » et de « prairies améliorées » (25 % chacune). Ah, un pays si verdoyant et agréable… mieux vaut donc ne pas s'attarder sur l'étendue des « prairies semi-naturelles », des « montagnes, landes et tourbières » et des « forêts de feuillus ». pourrait ont disparu depuis les cartes précédentes de 2000 et 1990.
