L'une des observations les plus fascinantes des plantes dans les habitats naturels est la co-variation spatiale qui existe entre les traits fonctionnels des plantes et les environnements naturels. Dans une nouvelle revue publiée dans AoBP, Honjo & Kudoh introduisent une petite herbe vivace clonale, Arabidopsis halleri comme système modèle pour étudier l'adaptation locale le long des gradients environnementaux. Le cycle biologique vivace et persistant de A. Halleri contraste avec le cycle biologique annuel de Arabidopsis thaliana. Les feuilles peuvent être produites toute l'année même à basse température en hiver et elles peuvent également faire de la photosynthèse tout au long de l'année. Les habitudes persistantes et vivaces profitent à l'étude de divers stress dans des conditions naturelles. Ils permettent de collecter des échantillons de tissus tout au long de l'année et permettent également des comparaisons entre les années en utilisant les mêmes individus.
Dans leur revue, les auteurs comparent A. Halleri à d'autres espèces dans le Arabidopsis genre, y compris les espèces végétales modèles Arabidopsis thaliana. Alors que des études sur A. thaliana ont généralement été de nature hautement moléculaire et/ou génétique, la plupart des études utilisant A. Halleri ont abordé l'adaptation et la variation des traits adaptatifs dans l'habitat naturel de l'espèce, ou comme les auteurs l'appellent "in natura“. Beaucoup se sont concentrés sur l'adaptation altitudinale de divers traits fonctionnels, y compris la tolérance aux ultraviolets B et les défenses anti-herbivores, d'autres se concentrant sur la différenciation des populations en réponse à la contamination par les métaux lourds dans les sols, un trait pour lequel cette espèce est bien connue. Les auteurs concluent en affirmant que A. Halleri nous offre de nouvelles opportunités pour étudier la différenciation des populations et l'adaptation locale, et les relier aux systèmes génétiques sous-jacents aux traits fonctionnels cibles.
Cette revue a été publiée dans le cadre de la AoBP Numéro spécial intitulé L'écologie et la génétique de la différenciation des populations chez les plantes.
Point culminant du chercheur
Mie N. Honjo a mené son projet de doctorat en écologie microbienne à l'Université de Kyoto, au Japon. Mie a fait son premier postdoctorat à l'Institut de recherche pour l'humanité et la nature de Kyoto et occupe actuellement un poste postdoctoral avec le professeur Hiroshi Kudoh au Centre de recherche écologique de l'Université de Kyoto.
Mie est une écologiste des plantes et des virus qui s'intéresse à l'étude de la saisonnalité et de la diversité des interactions plantes-virus dans les environnements naturels. Elle s'intéresse également à l'application de nouvelles techniques moléculaires à la biologie de terrain pour étudier les interactions entre l'hôte et d'autres organismes dans les environnements terrestres et aquatiques.
Hiroshi Kudoh a obtenu son doctorat en botanique à l'Université de Kyoto. Il a fait son post-doctorat en écologie des zones humides au Smithsonian Environmental Research Center, MD, USA, puis a obtenu son poste en écologie végétale à la Tokyo Metropolitan University, Japon. Il a déménagé à l'Université de Kobe en tant que professeur associé, puis à un poste actuel, celui de professeur d'écologie moléculaire au Centre de recherche écologique de l'Université de Kyoto.
Hiroshi est un écologiste végétal qui s'intéresse à l'étude de la phénologie, de l'adaptation locale, de la plasticité phénotypique et des interactions plantes-animaux au niveau de la fonction des gènes. Il a mis en place des sites de phénologie moléculaire à long terme dans les populations naturelles de Arabidopsis halleri subsp. gemmifère mener "Au naturel" études pour comprendre les fonctions écologiques des gènes.
