Le AoBP Prix ECOS célébrer les chercheurs qui ont consacré des efforts considérables à l'avancement des objectifs et des idéaux de la science ouverte. Aujourd'hui, nous nous concentrons sur les réalisations de Larry York (Noble Research Institute), l'un des trois lauréats des Prix ECOS 2020. Larry a impressionné le jury en tant que véritable défenseur de la science ouverte avec un bilan exemplaire qui comprend des publications en libre accès, des progiciels open source et des ensembles de données librement disponibles. Ci-dessous, vous pouvez lire sur le travail de Larry et comment il pense que son prix ECOS aidera à encourager la science ouverte dans son institution.
Une passion pour partager les connaissances
Grâce à l'enseignement et à la recherche ouverte, Larry a développé un amour du partage des connaissances avec les autres. Une partie de son engagement envers la science ouverte est motivée par une conviction éthique selon laquelle la connaissance est habilitante et devrait être gratuite pour tous pour l'amélioration personnelle et le bénéfice de la société. Larry est très passionné par le partage des connaissances, en particulier sur les racines, à la fois dans sa propre institution et avec la communauté au sens large. Il est très actif sur Twitter (@LarryMattYork et @RootPhenomics) et exécute le @RootBiologyNews compte pour permettre un accès facile aux informations sur les racines des plantes.
Prêcher par l'exemple
Larry espère que AoBP Le prix ECOS aidera à populariser les pratiques de science ouverte dans son institution d'origine et inspirera d'autres chercheurs en plantes à faire ce qu'ils peuvent pour partager des manuscrits, des données, des codes statistiques et des logiciels. Prêchant par l'exemple depuis qu'il a pris la tête du laboratoire de phénomique racine au Noble Research Institute, toutes les publications de son laboratoire ont été publiées en libre accès, les données ont été mises à disposition en ligne et deux progiciels open source ont été publiés sur GitHub et Zenodo. Il a également plaidé pour l'adoption de pratiques scientifiques ouvertes dans son institution et a co-écrit un cadre pour faciliter cela dans le cadre de son service au sein du comité de gestion des données. Larry a également organisé et co-organisé plusieurs ateliers axés sur le phénotypage racinaire, comme celui organisé avec IPPN à Noble en 2019, et un prochain atelier en ligne co-organisé avec le Dr Lindsay Triplett et le Société américaine de phytopathologie.
Phénomique racine open source
Larry est super excité par le dernier projet de science ouverte sorti du laboratoire de phénomique racine. RhizoVision Explorer (ci-dessus) est un nouveau progiciel gratuit et open source développé par des biologistes racinaires pour tous ceux qui souhaitent inclure des mesures racinaires dans leur travail (version publique prévue d'ici la fin septembre 2020). Les plans matériels de son labo Couronne RhizoVision plate-forme de phénotypage sont également largement documentés et ont été partagés en ligne. Le laboratoire a publié une prépublication sur phénotypage de l'absorption des nutriments taux par racines, et travaille actuellement sur un manuscrit portant sur la respiration des racines. De futures plates-formes sont prévues pour l'imagerie en laboratoire et sur le terrain (comme le chariot d'imagerie illustré ci-dessous).
Liens utiles vers le travail de Larry
Profil Google Scholar de Larry
Site Web du Noble Institute Root Phenomics Lab
Profil chercheur
Larry a grandi dans le sud-est du Kentucky, niché dans la forêt nationale Daniel Boone, et a terminé ses études de premier cycle en biologie à l'Université du Kentucky en 2006. Vers la fin de son programme de premier cycle, il s'est intéressé à un problème de modélisation écologique impliquant des interactions racinaires et a passionné par la biologie racinaire depuis. Il a obtenu son doctorat en écologie à l'Université d'État de Pennsylvanie en 2014. Sa recherche de thèse portait sur les interactions de l'architecture du système racinaire du maïs, de la physiologie et de l'environnement pour l'absorption d'azote. Il a complété des postes postdoctoraux à l'Université de Nottingham et à l'Université du Missouri avant de rejoindre la faculté du Noble Research Institute, une organisation de recherche agricole à but non lucratif, en 2017. Là, il a créé le laboratoire de phénomique des racines où les travaux actuels se concentrent sur l'ensemble. architecture et physiologie végétales avec emploi actif des pipeline de phénomique fonctionnelle, notamment en ce qui concerne l'optimisation des bilans carbone des racines et la capacité d'absorption. Les plans futurs incluent une étude plus approfondie des rôles que jouent les racines dans la santé du sol, et même le transfert de logiciels développés pour le phénotypage des plantes vers le phénotypage du sol.
