Les plantes monocotylédones sont divisées en 11 ordres : Acorales, Alismatales, Petrosaviales, Dioscoreales, Pandanales, Liliales, Asparagales, Arecales, Poales, Commelinales et Zingiberales, les quatre dernières étant regroupées dans le clade des Commelinides. Parmi celles-ci, les Asparagales sont peut-être les deuxièmes plus importantes pour l'agriculture et l'horticulture après les Poales (graminées). Les Asparagales comprennent les Orchidaceae avec plus de 30,000 XNUMX espèces, mais comprennent également des cultures importantes telles que l'aloès (Aloe vera), agave (Agave Tequilana), asperges (Asperge officinale), ail (Allium sativum), poireau (Allium ampéloprasum), oignon (Allium cepa) et vanille (Vanilla planifolia), ainsi que des plantes ornementales comme les yuccas, les amarylidés, les jonquilles, les iris. Avec un production mondiale annuelle de >95 Mt, c'est le troisième groupe le plus cultivé pour la production de légumes dans le monde après les Solanales (dont pomme de terre, tomate, poivron et aubergine) et les Cucurbitales (dont melons, concombres et courges).
Pour étendre notre compréhension de l'évolution du génome chez les monocotylédones, un article récent dans Annals of Botany examine les génomes de l'asperge et de l'oignon, avec un accent particulier sur la caractérisation des rétrotransposons à répétition terminale longue (LTR). Les résultats révèlent que les rétrotransposons LTR sont les principaux composants des génomes de l'oignon et de l'asperge potagère. Ces éléments sont pour la plupart intacts (c'est-à-dire avec deux LTR), se sont principalement insérés au cours des 6 derniers millions d'années et sont entassés dans des structures imbriquées. Certaines familles sont devenues particulièrement abondantes, jusqu'à 4–5 % (asperge) ou 3–4 % (oignon) du génome pour les familles les plus abondantes, comme on le voit également dans les génomes des grandes graminées comme le blé et le maïs. Bien que des annotations antérieures de séquences génomiques contiguës aient suggéré que les rétrotransposons LTR étaient fortement fragmentés dans ces deux génomes d'Asparagales, ces résultats montrent que cela était largement dû à la méthodologie utilisée. En revanche, ce travail indique un ensemble de caractéristiques génomiques similaires à celles observées chez les Poacées.
