Mention de plantes troglodytiques vivant in extremis [voir Découvrir la botanique souterraine] rappelle les vrais extrêmophiles de la planète Terre, connus – sans surprise ! - comme finphilès. Bien que les organismes de cette catégorie comprennent des représentants des trois domaines de êtres vivants - L' eucaryotes, les bactéries et Archaea, c'est cette dernière catégorie qui est la plus extrême les extrémophiles.

Parmi leurs rangs se trouvent des membres qui produisent du méthane (le méthanogènes), les acidophiles qui vivent à pH extrêmes, et les halophiles qui prospèrent dans de très milieux salins. Maintenant, chers lecteurs, étant une bande d'érudits, à quels environnements pensez-vous à la mention de ces organismes ? Extrêmement piscines salées, Oui; sources de soufre à pH très bas, Oui encore; et, haute pression, haute température évents en haute mer, oui trois fois. Mais, qui d'entre nous aurait suggéré l'intérieur d'un arbre ? Pas moi pour ma part. Pourtant, c'est l'habitat improbable où des archées méthanogènes ont été trouvées par Daniel Yip et al..

Depuis une durée indéterminée, ces microbes producteurs de méthane font discrètement ce qu'ils font, sous notre nez. Mais c'est parce que le méthane (ou ce qu'on appelle gaz naturel) qu'ils publient n'est pas célèbre Avoir tout odeur que ces unicellules invisibles pourraient exister là où elles existent sans que nous en soyons vraiment conscients*. À l'aide d'analyses de séquences de gènes d'ARNr 16S**, Yip et al. trouvé le bois de Populus deltoides dominée par l'anaérobie ("existant en l'absence d'oxygène libre”) microbiome (“une communauté de micro-organismes”). Parmi lesquels, les méthanogènes prédominaient dans le bois de cœur («le cylindre central trouvé dans les troncs d'arbres”) où les “unités taxonomiques opérationnelles dominantes” (OTU***) ont été classées comme Méthanobactérie sp..

À quel point ces microbes pourraient être répandus dans les arbres P. deltoïdes autre que les 13 individus échantillonnés, ou parmi d'autres espèces d'arbres n'est pas encore connue. Cependant, cette découverte est pertinente pour comprendre le flux de carbone entre l'atmosphère et les organismes vivants. Par exemple, j'étais généralement amené à croire qu'en tant que tel entités à longue durée de vie, les arbres sont un évier majeur pour CO atmosphérique₂. Cependant, s'ils abritent également des microbes méthanogènes, ils doivent aussi désormais être considérés comme une source de carbone pour le méthane (CH₄) ils libèrent. Et, point crucial, le méthane n'est pas seulement un autre gaz à effet de serre (GES) qui contribue à au réchauffement climatique - comme CO₂ - mais est aussi beaucoup plus puissant (c'est-à-dire "efficace") piégeage de la chaleur molécule que le CO₂.

Bien que les quantités individuelles de méthane d'un arbre puissent être minuscules, multipliez cela par le nombre d'individus dans une population, puis par le nombre d'autres espèces d'arbres contenant du méthanogène, etc., et cela peut être une quantité assez importante. Et est encore une autre source jusqu'ici non reconnue de matières organiques réchauffant la planète à ajouter à la croissance de plus en plus complexe carbone cycle.

Emplacements tonnelle 'des méthanogènes arborés qui font monter la température sur la planète Terre ? En effet, le méthane inflammable fabriqué par des microbes pourrait-il être un facteur contributif à la propagation des incendies de forêt qui ont brûlé de vastes zones de la planète pendant l'été sur 2018?

[Éd. – Un clip vidéo montrant la combustion du méthane [Les extraits provenant du bois de cœur peuvent être vus sur New Phytologist].

* Les auteurs de l'article du New Phytologist reconnaissent que les comptes rendus de méthanogènes dans le bois des arbres ont été signalés pour la première fois il y a des décenniesLa distinction est que leur travail du 21e siècle est le premier à « revisiter » de telles histoires en utilisant des approches modernes d'écologie moléculaire.

** Cette technique ne révèle pas réellement les bactéries, contrairement à un microscope, pour faciliter leur identification. Elle repose plutôt sur la détection de différences de séquence dans des régions très variables du gène 16S r(ribosomal)RNA, dont le produit fait partie de la protéine synthétisant cette protéine. ribosome qui est unique à et présent dans tout 'bactéries'. La comparaison des différentes séquences identifiées dans un échantillon avec des séquences publiées d'organismes identifiés permet ainsi d'identifier les bactéries présentes, sans pour autant les voir de ses propres yeux – comme le font des chercheurs Zeikus et Ward aurait dû faire dans le « bon vieux temps »…

*** Un OTU is une forme substitutive d'identification d'une espèce sans observer réellement l'organisme, et suppose ici que des séquences d'ARNr 16S similaires proviennent du même organisme, et que des séquences différentes proviennent donc d'espèces différentes.